同位素標(biāo)記定量

iTRAQ（isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation）&TMT（Tandem Mass Tags）分別由AB Sciex公司和Thermo公司研發(fā)的多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)，利用多種同位素試劑標(biāo)記蛋白多肽N末端或者賴氨酸側(cè)鏈基團(tuán)，不同分子量的試劑對(duì)不同來(lái)源的樣品進(jìn)行標(biāo)記從而實(shí)現(xiàn)不同樣品間蛋白質(zhì)組的比較。

iTRAQ/TMT試劑由三部分組成：報(bào)告基團(tuán)、平衡基團(tuán)和反應(yīng)基團(tuán)。反應(yīng)基團(tuán)形成2-10種等質(zhì)量同位素標(biāo)簽。iTRAQ/TMT試劑標(biāo)記酶解后的肽段，可與氨基酸N端及側(cè)鏈的伯胺基團(tuán)發(fā)生反應(yīng)。在一級(jí)譜圖中，來(lái)自于不同樣本的同一肽段，標(biāo)記后表現(xiàn)為相同的質(zhì)荷比。在二級(jí)譜圖中，報(bào)告基團(tuán)、平衡基團(tuán)和反應(yīng)基團(tuán)之間的鍵斷裂，帶不同同位素標(biāo)簽的同一肽段產(chǎn)生質(zhì)量不同的報(bào)告離子，根據(jù)報(bào)告離子的豐度可獲得樣本間相同肽段的定量信息，再經(jīng)過(guò)軟件處理得到蛋白質(zhì)的定量信息。

iTRAQ實(shí)驗(yàn)步驟

1. 樣品制備

2. 酶解消化

3. iTRAQ標(biāo)記：

4. 樣本混合/肽段分級(jí)

5. 數(shù)據(jù)處理及生信分析

結(jié)果展示

火山圖

實(shí)驗(yàn)周期及交付標(biāo)準(zhǔn)

1. 實(shí)驗(yàn)周期：6周左右

2. 交付標(biāo)準(zhǔn)：蛋白定量結(jié)果、鑒定結(jié)果、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)、生信分析結(jié)果（GO分析、KEGG分析等等）

需確認(rèn)的信息

1. 樣本的種屬

2. 樣本的類型（組織or細(xì)胞or血液）

3. 樣本的數(shù)量及分組

4. 分析要求